这是我做过的一个自定义过滤器， GetLatestColumnsFilter ，它可以用来获取具有最新时间戳的列，我认为可以用来解决您的问题。

public class GetLatestColumnsFilter extends TimestampsFilter {
    private long max;

    public GetLatestColumnsFilter() {
        super(new ArrayList<>());
        max = -1;
    }

    @Override
    public ReturnCode filterKeyValue(Cell v) {
        if (-1 == max) {
            max = Long.valueOf(v.getTimestamp());
        } else if (max != Long.valueOf(v.getTimestamp())) {
            return ReturnCode.SKIP;
        }
        return ReturnCode.INCLUDE;
    }

    public static GetLatestColumnsFilter parseFrom(byte[] pbBytes) throws DeserializationException {
        return new GetLatestColumnsFilter();
    }

}

从hbase 0.94版官方指南中，您可以看到：
通过创建墓碑标记删除工作。例如，假设我们要删除一行。为此，您可以指定一个版本，或者默认使用currenttimemillis。这意味着“删除版本小于或等于此版本的所有单元格”。hbase从不就地修改数据，例如，delete不会立即删除（或标记为已删除）存储文件中与delete条件相对应的条目。相反，写一个所谓的墓碑，它将掩盖删除的值[17]。如果删除行时指定的版本大于行中任何值的版本，则可以考虑删除整行。
所以我不认为遵循标准的删除过程有什么问题。
但是，如果只想删除单元格的最新版本，可以使用 setTimestamp 扫描类的方法。所以，你可以做的是：

List<Delete> deletes = new ArrayList<>();
Scan scan = new Scan();
scan.setTimestamp(latestVersionTimeStamp); //latestVersionTimeStamp is a long variable
//set your filters here
ResultScanner rscanner = table.getScanner(scan);
for(Result rs : rscanner){
    deletes.add(new Delete(rs.getRow()));
}
try{
    table.delete(deletes);
}
catch(Exception e){
    e.printStackTrace();
}

但是，如果你的时间戳在不同的单元格中是不一样的，这将不适用于所有的单元格。这可能会。

List<Delete> deletes = new ArrayList<>();
ArrayList<long> timestamps =  new ArrayList<>();//your list of timestamps
Delete d;
Scan scan = new Scan();
//set your filters here
ResultScanner rscanner = table.getScanner(scan);
for(Pair<Result, long> item : zip(rscanner, timestamps)){
    d=new Delete(item.getLeft().getRow())
    d.setTimestamp(item.getRight());
    deletes.add(d);
}
try{
    table.delete(deletes);
}
catch(Exception e){
    e.printStackTrace();
}

不过，我不能保证这会奏效。官方的指南很模糊，我可能误解了任何东西。如果我确实误解了，请提醒我，我将删除此答案。
在这里，我为scan类提供了informationsettimestamp方法，为delete类提供了settimestamp方法