你必须寻找
indexOf value 在里面 specArr 不是
valueOf specArr 在里面 specArr ```
let index = specArr.indexOf(value)

const item = document.querySelector('.item');
const value = 'Insert into array';
let specArr = [];

item.addEventListener('change', function(e) {

// Push value into array
if (item.checked) {
specArr.push(${value})
console.log(specArr);

//    Remove value from array

} else if (!item.checked) {
let index = specArr.indexOf(value)
if (index != -1) {
specArr.splice(index, 1);
console.log(specArr);
}
}
})

Item 1

函数array.prototype.filter（）非常适合解决此问题。使代码简单而智能。

const item = document.querySelector('.item');
const value = 'Insert into array';
let specArr = [];

item.addEventListener('change', function(e) {
  if (item.checked) {
    specArr.push(`${value}`)
  } else {
    specArr = specArr.filter(item => item !== value)
  }
  console.log(specArr);
})

<input class="item" type="checkbox"> Item 1

specArr.indexOf(specArr) 正在寻找 specArr 在里面 specArr ，这是不存在的。相反，寻找 value .
尝试：

const item = document.querySelector('.item');
const value = 'Insert into array';
let specArr = [];

item.addEventListener('change', function(e) {
  if (item.checked) {
    specArr.push(`${value}`)
    console.log(specArr);
  } else if (!item.checked) {
    let index = specArr.indexOf(value)
    if (index != -1) {
      specArr.splice(index, 1);
      console.log(specArr);
    }
  }
})

<input class="item" type="checkbox"> Item 1