我第一次玩vtk和stl文件。你的问题让我很好奇，但我显然没有经验。我开始研究这之前，上述评论。我没有意识到我们离题，对不起。所以我给予你我的结论在这一点上，因为有建立共享。
1)for .vtk文件事实证明，我看到的大多数库都是针对python 2.7的，而我更喜欢最新的版本（目前是3.5）。对于3.5，我最终采用了看起来很有前途的'woodscn'版本，对于编码来说，在我看来所有需要的信息都在Reading a .vtk file with python上
2)对于.stl文件，'conda-forge'中的'xml'包看起来很好，在https://github.com/fhcrc/nestly/blob/master/examples/basic_nest/make_nest.py上有一个典型的例子
然后你只需要在python脚本中写import vtk和import nestly。
希望这有帮助

我将提供更多关于python/elastix业务的意见，因为我自己才刚刚整理出来，这并不容易。这些是它可以使用的方式：

1. SimpleITK.一个python模块，通常作为预编译的二进制文件提供，它具有ImageRegistrationMethod（）的一些注册功能。我认为这可能是Elastix的实现，或者类似于Elastix，但没有深入确认。无论出于何种原因，我无法找出在我的特定数据集上工作所需的许多选项。
2. SimpleITK-SimpleElastix. SimpleITK的第三方扩展，具有与elastix不同/改进的接口，包括似乎工作得很好的默认值。SimpleITK不支持此扩展。可作为pypi上的预编译二进制文件提供。然而，pypi上的Linux二进制文件最近没有更新，并且缺少一些较新的SimpleITK功能。macos二进制文件上个月刚刚更新。
3. Github上的SimpleITK源代码。在启用Elastix选项的情况下重新编译。这个过程是您如何将新的SimpleITK功能与实际的Elastix代码一起沿着的。编译在四个核心上运行了一个多小时，看不到尽头，我知道我还必须弄清楚Windows上的编译，所以我放弃了这个。
4. Github上的SimpleElastix源代码。基本上与上面的#3相同的方法，唯一的区别是，在这个源发行版中，Elastix不是几个选项之一，而是主要的一点。我没有具体确认这是否是上面的#2的源代码。如上所述，这可能需要几个小时来编译。
5. ITKElastix.一个python的预编译二进制文件。ITK可能不像SimpleITK那样为python用户所熟悉，但是在语法上有很多重叠，并且对于注册Elastix代码是相同的。我在使用F连续numpy数组时遇到了一个问题：itk elastix注册给出了一个无意义的结果。当我切换到C连续的东西工作。这可能是显而易见的经验丰富的ITK/C++程序员，但作为一个python用户，我不这么认为。