步骤总结

下载phpmyadmin
配置phpmysql的配置文件
所有库有账号通过远程连接MySQL(mysql的grant授权)
登录测试(如果有做数据库的主从要检查用户授权，防止数据的不一致)

环境说明

Linux版本于内核号 	CentOS release 6.5 (Final) 2.6.32-431.el6.x86_64
PHP版本             5.3.28
Phpmyadmin版本		phpMyAdmin-4.4.15-all-languages
MySQL多实例 		192.168.0.200:3307和192.168.0.200:3308(其中3307为master 3308为slave)

具体操作

方法一

通过修改 phpmyadmin/libraries/config.default.php 大概在805行的$cfg['AllowArbitraryServer'] = true; # allow login to any user entered server in cookie based authentication，效果如下图：

进行登录，当然这种方式依然得方法一中第四步的授权，这里就不在赘述。(此方法测试未成功，继续关注)

总结

缺点：登陆操作比较繁琐，而且切换服务器时须首先退出当前所登陆的服务器

方法二

1. 下载phpmyadmin

到https://www.phpmyadmin.net/downloads/下载phpMyAdmin-4.4.15-all-languages，解压到网站根目录下重命名为phpmyadmin

2. 编辑配置文件

cp config.sample.inc.php config.inc.php 复制根目录下的config.sample.inc.php为config.inc.php，使用 sed -i '22,34s#^#//#g' config.inc.php使用sed命令注释掉之前相关行并编辑这个文件，添加一个$hosts数组和一个for循环

// /*
//  * First server
//  */
// $i++;
// /* Authentication type */
// $cfg['Servers'][$i]['auth_type'] = 'cookie';
// /* Server parameters */
// $cfg['Servers'][$i]['host'] = 'localhost';
// $cfg['Servers'][$i]['connect_type'] = 'tcp';
// $cfg['Servers'][$i]['compress'] = false;
// /* Select mysql if your server does not have mysqli */
// $cfg['Servers'][$i]['extension'] = 'mysqli';
// $cfg['Servers'][$i]['AllowNoPassword'] = false;

$hosts = array(
'1'=>array('host'=>'192.168.0.200','user'=>'phpmyadmin','password'=>'phpmyadmin','port'=>3307),
'2'=>array('host'=>'192.168.0.200','user'=>'phpmyadmin','password'=>'phpmyadmin','port'=>3308)
);

for($i=1,$j=count($hosts);$i<=$j;$i++){
	/* Authentication type */
	$cfg['Servers'][$i]['auth_type'] = 'cookie';
	/* Server parameters */
	$cfg['Servers'][$i]['host'] = $hosts[$i]['host'];   //修改host
	$cfg['Servers'][$i]['port'] = $hosts[$i]['port']; 
	$cfg['Servers'][$i]['connect_type'] = 'tcp';
	$cfg['Servers'][$i]['compress'] = false;
	/* Select mysqli if your server has it */
	$cfg['Servers'][$i]['extension'] = 'mysqli';
	$cfg['Servers'][$i]['AllowNoPassword'] = true;
	$cfg['Servers'][$i]['user'] = $hosts[$i]['user'];  //修改用户名
	$cfg['Servers'][$i]['password'] = $hosts[$i]['password']; //密码
	/* rajk - for blobstreaming */
	$cfg['Servers'][$i]['bs_garbage_threshold'] = 50;
	$cfg['Servers'][$i]['bs_repository_threshold'] = '32M';
	$cfg['Servers'][$i]['bs_temp_blob_timeout'] = 600;
	$cfg['Servers'][$i]['bs_temp_log_threshold'] = '32M';
}

更改完成后刷新登录页面，发现是不是多了些什么？我们可以选择不同的服务器(或者不同的端口)进行登录了。

3. 登录到服务器授权不同的登录账号

由于这边192.168.0.200:3307为master，我们在3307端口上进行授权：
grant all privileges on *.* to 'phpmyadmin'@'192.168.0.%' identified by 'phpmyadmin' WITH GRANT OPTION;
如果3307和3308已经实现了主从同步，那么我们可以通过用户名为phpmyadmin和密码为 phpmyadmin登录了，但是这样授权是十分不安全的。建议在生产环境中不要这么粗暴的使用，另外我们需要对slave实例进行回收权限，登录192.168.0.3308，操作如下：
REVOKE INSERT,ALTER,CREATE,DELETE,DROP,UPDATE ON *.* FROM 'phpmyadmin'@'192.168.0.%'

另可以通过show privileges;查看更多授权权限以及相关作用。

效果如下

相关的增删改操作提示无权限，防止用户误操作引起的主从同步数据的不一致。(这里也可以配置mysql库的主从不同步，然后分别在3307和3308端口上授予用户不同的权限即可)。

总结

优点：登陆操作简便，登陆后切换服务器无须退出当前连接。

特别说明

方法一、方法二不可混用，如果按照方法一进行了操作，那么方法二将无法生效

配置phpmyadmin连接多实例MySQL