最简单和最直接的答案是将文件直接放在hdfs或s3中（因为您提到了aws），并将hadoop/mahout直接指向它们。其他数据库有不同的用途，但hadoop/hdfs正是为这种高容量、批处理风格的分析而设计的。如果您想要一个更具数据库风格的访问层，那么您可以添加配置单元而不需要太多麻烦。底层存储层仍然是hdfs或s3，但是hive可以为您提供对存储在那里的数据的类似sql的访问，如果您需要的话。
只是为了解决您提出的另外两个选项：mongodb适用于低延迟读写，但您可能不需要它。我不太了解mysql的所有高级功能，但我猜100tb对它来说是相当困难的，尤其是当你开始进入访问所有数据的大型查询时。它更适合于传统的事务性访问。