经过一天的努力，我的问题的答案如下：

import happybase

CDH6_HBASE_THRIFT_VER='0.92'

hbase_cnxn = happybase.Connection(
    host='vps00', port=9090,
    table_prefix=None,
    compat=CDH6_HBASE_THRIFT_VER,
    table_prefix_separator=b'_',
    timeout=None,
    autoconnect=True,
    transport='framed',  # Default: 'buffered'  <---- Changed.
    protocol='compact'   # Default: 'binary'    <---- Changed.
)

print('tables:', hbase_cnxn.tables()) # Works. Output: [b'ns1:mytable', ]

请注意，尽管本问答是在 Cloudera ，原来（你会看到）这是 Thrift 版本和 Thrift 服务器端配置相关，因此它适用于 Hortonworks 以及 MapR 用户也是。
说明：
在 Cloudera CDH v6.1.x 如果你访问 Hbase Thrift Server Configuration 在它的管理u.i.部分，你会发现——在许多其他设置中——这些：

注意 compact protocol 以及 framed transport 都已启用；因此，他们相应地需要改变 happybase 从它的默认值（我在上面显示）。
正如在我的第一个问题的后续编辑中提到的，我还调查了一个纯粹的 Thrift （非 happybase )解决方案。通过对python代码进行类似的修改，我也实现了这一点。下面是你应该使用的纯代码 Thrift 解决方案（注意阅读下面我的注解）：

from thrift.protocol import TCompactProtocol             # Notice the import: TCompactProtocol [!]
from thrift.transport.TTransport import TFramedTransport # Notice the import: TFramedTransport [!]
from thrift.transport import TSocket
from hbase import Hbase
   # -- This hbase module is compiled using the thrift(1) command (version >= 0.10 [!])
   #    and a Hbase.thrift file (obtained from http://archive.apache.org/dist/hbase/
   # -- Also, your "pip freeze | grep '^thrift='" should show a version of >= 0.10 [!]
   #    if you want Python3 support.

(host,port) = ("vps00","9090")
transport = TFramedTransport(TSocket.TSocket(host, port))
protocol  = TCompactProtocol.TCompactProtocol(transport)
client = Hbase.Client(protocol)

transport.open()

# Do stuff here ...

print(client.getTableNames()) # Works. Output: [b'ns1:mytable', ]

transport.close()

我希望这能减轻人们对我的痛苦
信用：
这里（mapr）和
这里（来自中国的博客）