documentation表示：
创建一个数组的副本，数组中的元素以这样的方式重新排列，即第k个位置的元素的值位于排序数组中的位置。所有小于第k个元素的元素都被移到该元素之前，所有等于或大于第k个元素的元素都被移到该元素之后。两个分区中元素的顺序未定义。
在你给予的例子中，你已经选择了排序列表的第2个元素（从零开始），它是-1，如果数组被排序，它似乎在正确的位置。

docs谈论“排序数组”。
np.partition首先对提供的数组中的元素进行排序（参见@norok2的注解）。在本例中，原始数组为：

arr = [ 5,  4,  1,  0, -1, -3, -4,  0]

排序后，我们有：

arr_sorted = [-4 -3 -1  0  0  1  4  5]

因此，调用np.partition(arr, kth=2)实际上将kth作为arr_sorted的位置2的元素，而不是arr。该元素被正确地选择为-1。

我第一次看numpy.partition的官方文档的时候，也是按照OP的方式来解释它的意思的，所以看文档里给出的例子的时候，我也是一头雾水，但是又想不出自己的理解错在哪里，我google了一下，就到了这里。
考虑到混淆的情况经常发生，所以文档应该进行修改。我建议使用以下内容：
创建数组的副本，其中数组的元素按以下方式重新排列：新数组的第k个元素位于排序数组中的位置。所有小于第k个元素的元素都移动到该元素之前，所有大于该元素的元素都移动到该元素之后。两个分区中元素的顺序未定义。如果有其他元素等于第k个元素，则这些元素可能出现在第k个元素之前或之后。