我正在使用nibabel包将一些nparray保存为nifti格式。我指定了一个斜率和截距值，以便将数据缩放回原始格式。然而，当我加载回数据时，scale和截距信息不再可用。下面是一个代码片段来重现该行为：
import numpy as np
import nibabel as nib
# Create dumb 3D data:
img=np.ones((20,20,5),dtype=np.uint16)
# Create an affine matrix:
affine=np.eye(4)
# Create nifti
nii=nib.Nifti1Image(img,affine=affine)
# Set slope and inter values
nii.header.set_slope_inter(slope=1,inter=0)
# Save the nifti on disk
nib.save(nii,'test.nii')
# Load back the data
nii2=nib.load('test.nii')
# Get the slope and inter
print(nii2.header.get_slope_inter())
# It returns (None, None)字符串
输出为(None,None)，尽管nii2.header.has_data_slope和nii2.header.has_data_intercept都返回True。
我用mango和itk-snap等nifti阅读器打开了nifti文件，可以检查斜率和截距是否正确显示。
这是一个bug吗？
谢谢你的帮助！
1条答案
按热度按时间tcomlyy61#
不，这不是一个bug。这种行为在Nibabel的文档中有记录。
当第一次创建/加载时，nifti 1对象（Nibabel图像）具有可访问的比例斜率和截距：
字符串
要回答您的问题，在调用set_slope_inter（）之后，您设置的新值可在以下位置获得：
型
有点晚了，但我希望这能帮助到别人！