本文整理了Java中org.broadinstitute.gatk.utils.Utils.reverse()方法的一些代码示例，展示了Utils.reverse()的具体用法。这些代码示例主要来源于Github/Stackoverflow/Maven等平台，是从一些精选项目中提取出来的代码，具有较强的参考意义，能在一定程度帮忙到你。Utils.reverse()方法的具体详情如下：
包路径：org.broadinstitute.gatk.utils.Utils
类名称：Utils
方法名：reverse

Utils.reverse介绍

[英]Reverse (NOT reverse-complement!!) a string
[中]反向（不是反向补码！！）一串

代码示例

代码示例来源：origin: broadgsa/gatk

/**
 * Reverse (NOT reverse-complement!!) a string
 *
 * @param bases  input string
 * @return the reversed string
 */
static public String reverse(String bases) {
  return new String( reverse( bases.getBytes() )) ;
}

代码示例来源：origin: broadgsa/gatk

for ( final GenomeLoc masterPart : Utils.reverse(masterHead.subtract(testHead)) ) {
  master.push(masterPart);

代码示例来源：origin: broadgsa/gatk

ref = Utils.reverse(ref);
read = Utils.reverse(read);

代码示例来源：origin: broadgsa/gatk

byte[] reverseReferenceSequence = Utils.reverse(normalizedReferenceSequence);

代码示例来源：origin: broadgsa/gatk

Byte[] complementedBases = normalizeBases(Utils.reverse(BaseUtils.simpleReverseComplement(read.getReadBases())));

代码示例来源：origin: broadgsa/gatk

if(alignment.isNegativeStrand()) {
  read.setReadBases(BaseUtils.simpleReverseComplement(read.getReadBases()));
  read.setBaseQualities(Utils.reverse(read.getBaseQualities()));