org.opencb.opencga.storage.core.variant.adaptors.VariantQueryUtils.toVariant()方法的使用及代码示例

x33g5p2x  于2022-02-01 转载在 其他  
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本文整理了Java中org.opencb.opencga.storage.core.variant.adaptors.VariantQueryUtils.toVariant()方法的一些代码示例,展示了VariantQueryUtils.toVariant()的具体用法。这些代码示例主要来源于Github/Stackoverflow/Maven等平台,是从一些精选项目中提取出来的代码,具有较强的参考意义,能在一定程度帮忙到你。VariantQueryUtils.toVariant()方法的具体详情如下:
包路径:org.opencb.opencga.storage.core.variant.adaptors.VariantQueryUtils
类名称:VariantQueryUtils
方法名:toVariant

VariantQueryUtils.toVariant介绍

[英]Determines if the given value is a variant id or not.

chr:pos:ref:alt
[中]确定给定值是否为变量id。
chr:pos:ref:alt

代码示例

代码示例来源:origin: opencb/opencga

Variant variant = toVariant(value);
  if (variant != null) {
    xrefs.getVariants().add(variant);
List<String> xrefsList = query.getAsStringList(ANNOT_XREF.key(), OR);
for (String value : xrefsList) {
  Variant variant = toVariant(value);
  if (variant != null) {
    xrefs.getVariants().add(variant);

代码示例来源:origin: opencb/opencga

throw VariantQueryException.malformedParam(ID, ids.toString(), "Unsupported multiple variant ids filter");
Variant variant = VariantQueryUtils.toVariant(ids.get(0));
addVariantIdFilter(scan, variant);
regionOrVariant = variant;

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